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Ausbau von dezentralen Forschungsprojekten mit DataSHIELD
Bisher verhindern Datenschutzbedenken und das Fehlen von spezieller IT-Infrastruktur die Ausweitung von institutsübergreifenden Forschungsprojekten.
Aufgrund der historisch gewachsenen Heterogenität bei Probanden-Einverständniserklärungen in epidemiologischen Studien sowie verschiedenen gesetzlichen Regulierungen und Datenschutzbestimmungen an den jeweiligen Forschungsstandorten gibt es beträchtliche Einschränkungen für Institute, personenbezogene Gesundheitsdaten mit anderen Kooperationspartnern innerhalb eines Forschungsprojektes zu teilen. Ausgehend von dieser Basis, sollen Projektpartner im Rahmen von NFDI4Health dahingehend ermächtigt werden, an für sie interessanten
DataSHIELD Netzwerk
NFDI4Health unterstützt den Prozess der (Erst-)Installation und Updates von DataSHIELD IT-Infrastruktur bei verschiedenen Instituten, die Teil von NFDI4Health sind (bislang 4 Mit-Antragssteller, 3 partizipierende Institute), damit diese für zukünftige Forschungsprojekte im Bereich der verteilten Datenanalyse gut aufgestellt sind. Diese Arbeit hat bereits die Teilnahme dieser epidemiologischen Studien an einem europäischen Projekt (“Differences in the microbiome composition in obese and non-obese individuals and its relationship to diet”) innerhalb der “Knowledge Platform Intestinal Microbiomics” (INTIMIC-KP) ermöglicht, bei dem ein erstes Projekt “Federated analysis of the association between body mass index and gut microbiota
composition among adults from multiple European observational studies” (Schwedhelm, C. et al., DGEpi 2023) erfolgreich abgeschlossen wurde.
Des Weiteren wurden neue DataSHIELD Pakete durch NFDI4Health entwickelt:
- Client-Server-seitige Pakete, die fehlende Funktionen in DataSHIELD adressieren [dsIntestinalMicrobiomics, dsClusterAnalysis]
- Client-seitiges Paket für verbesserte Analyse-Erfahrungen der Forscher [datashieldDescriptives]
- Paket zur Unterstützung für DataSHIELD-Entwickler [DSFunctionCreator]
Figure 1: NFDI4Health-unterstützter Ausbau der DataSHIELD Infrastruktur (Installationen und Updates) in datenbesitzenden Institutionen in Deutschland (blau: vollständig abgeschlossen, orange: in Arbeit; Stand: 15.09.2023)
Anwendung innerhalb von NFDI4Health
Innerhalb von NFDI4Health gibt es drei Pilotprojekte, welche zurzeit die Metadaten von teilnehmenden Instituten sammeln und die unterschiedlichen Datensätze harmonisieren:
1. Systematic investigation of methodological limitations in the derivation of exploratory dietary patterns
2. Association of dietary sugar intake and body composition [among participants with genetic predisposition for a high sugar intake]
3. Association of dietary sugar intake and glycemic load with chronic disease risk.
Angebote von NFDI4Health
Sie repräsentieren eine datenbesitzende Institution und möchten Forschern ihre Daten zugänglich machen und DataSHIELD an ihrer Institution implementieren?
- Umfassende SOPs, die durch die Installation und Konfiguration von Opal und DataSHIELD führen sowie Hilfestellung für den Datenimport und User-Management geben [SOP].
- Unterstützung bei der Fehlersuche.
Sie sind ein Analyst mit einer spannenden Forschungsfrage und wollen DataSHIELD für ihr Projekt benutzen?
- Eine nahtlos integrierte Analystenerfahrung, die eine Analyseumgebung zusammen mit einem einheitlichen Anmeldeinformationssystem umfasst (in Arbeit).
- Start R Scripts, die ihnen den Einstieg erleichtern.
- Erstellen neuer Funktionen, um ihre Forschungsfragen zu beantworten.
- Unterstützung bei der Fehlersuche.
